Szkoła Podstawowa w Kłodzinie została powołana po raz pierwszy po II Wojnie Światowej w roku 1958. Do tego czasu tamtejsza młodzież pobierała naukę w Szkole Podstawowej w Przelewicach.
Początkowo szkołę ulokowano w pałacu i wydzielono na jej potrzeby zaledwie trzy pomieszczenia. Ówczesny obwód szkoły obejmował miejscowości: Kłodzino i Czartowo. Była to jednak niepełna szkoła, o niskim stopniu organizacyjnym, z najwyższą klasą czwartą i z jednym nauczycielem kierującym - Panem Tadeuszem Soszyńskim. Naukę rozpoczynało wówczas 57 dzieci.
6 lutego 1961 roku szkoła została przeniesiona do budynku, w którym wcześniej funkcjonowała izba porodowa.
Od roku szkolnego 1961/1962 przekształcono ją w pełną szkołę podstawową z 7 klasami i 7 oddziałami. Wówczas zatrud- nionych w niej było 4 nauczycieli. Od roku szkolnego 1973/1974 w myśl koncepcji utworzenia gminnych szkół zbiorczych, powstała na terenie gminy Zbiorcza Szkoła Gminna w Przelewicach. W związku z tym w budynku szkoły w Kłodzinie - punkcie filialnym - powstały oddziały klas I-IV, zaś w Przelewicach V-VIII. W 1984 roku powstał Społeczny Komitet Rozbudowy Szkoły, którego zadanie polegało na zebraniu funduszy potrzebnych do budowy nowego obiektu szkolnego. Lata 1991-93 to okres intensywnych prac nad kolejną reorganizacją szkoły. Oddano do użytku nowy, duży budynek, który przywrócił placówce rangę pełnej szkoły podstawowej.

W wyniku likwidacji Szkoły Podstawowej w Klukach, później Szkoły Podstawowej w Przelewicach (do której uczęszczały również dzieci ze zlikwidowanej wcześniej szkoły w Bylicach), a następnie w Laskowie, obwód szkoły znacznie się powiększył. Obecnie szkoła liczy 11 oddziałów, w tym 2 oddziały przedszkolne umiejscowione w siedzibie Biblioteki Gminnej w Przelewicach.